RTP-tiedosto on molekyylidatatiedosto, jota Gromacs käyttää, ohjelma, jota käytetään molekyylidynamiikan simulointiin. Se säästää jäännöstietoja, jotka edustavat molekyylin perusosia ja voivat sisältää atomeja, sidoksia, kulmia, dihedraaleja ja parantajia. RTP-tiedostoja käytetään datatiedostoina molekyylianalyyseihin.
RTP-tiedostoja käyttää pdb2gmx, Gromacs-ohjelma, jota käytetään Protein Data Bankin muuntamiseen (.PDB) tiedostot Gromacs-topologioihin (.TOP tiedostot).
HUOMAUTUS: Gromacs on lyhenne sanoista Groningen Machine for Chemical Simulations.