.AHTAA Tiedostopääte

Euroopan molekyylibiologian laboratorion ulkopuolisen EBI: n kehittämä pakattu kohdistustiedostomuoto; tallentaa lyhyet DNA-sekvenssin luetut kohdistukset, jotka on luotu lyhytlukuisista kohdistimista, kuten BWA, BBMap ja BLAT.

CRAM-tiedostomuoto on samanlainen kuin Binary Alignment / Map (BAM) -tiedostomuoto, mutta siinä on parempi tiedostojen pakkaus ja uudelleenrakennettu sarakekohtainen binäärisäiliön muoto. Kun datamäärät kasvavat geneettisen ohjelmiston kentässä, CRAM-muoto on suunniteltu vähentämään kohdistustietojen levyn jalanjälkeä.

Lyhyt luettavuus on prosessi, jolla puretaan sekvenssi genomista. Tämä voi olla vaikeaa, koska vertailugeeni on melko suuri, etkä aina etsi tarkkoja vastaavuuksia vertailugeenistä. Lyhytlukuisia kohdistimia käytetään etsimään valtavia sekvenssejä otteluista ja lähitaisteluista. Koska sekvenssit ovat niin suuria, CRAM: n kaltaisten tiedostomuotojen pakkaus on välttämätön, jotta tiedostokoot pysyvät hallittavissa.