MKD-tiedosto on tekstitiedosto, joka on luotu käyttämällä yhtä monista mahdollisista Markdown-kielen murteista. Se tallennetaan pelkkänä tekstimuotona, mutta sisältää tekstisisällöt, jotka määrittelevät tekstin muotoilun (esim. Lihavoitu, sisennykset, otsikot, taulukon muotoilu). MKD-tiedostot voidaan tallentaa myös nimellä MD, ALAStai .DOWN Tiedostojen
MKD-tiedostoa käytetään yksinkertaisen tekstidokumentaation luomiseen, joka voidaan helposti muuntaa HTML. Ne eivät kuitenkaan ole hyödyllisiä vain HTML-dokumentointijärjestelmille, mutta myös lähdekoodiversioiden hallintaan. MKD-tiedostoja voidaan verrata historiallisiin versioihin ihmisen luettavassa tekstissä, kun taas binaarimuodoa ei voida helposti verrata.